RasMolを使ってみよう


DNAに結合したLac IのNMRによる構造(1L1M)を使って見やすい画像に加工しよう。
準備
1. RasMolをOpenRasMolからダウンロード。
2. 1L1MをProtein Data Bankからダウンロード。
3. RasMolを起動し、1L1Mを開く。



これから先の作業はすべてCommand(太字で表記)を入力して行います。
手順
1. 始めに表示される構造はwireframeで表示されているので一度全部消します。

wireframe off

2. DNAを選択し、太さ50のwireframeで再描画します。

select dna
wireframe 50



3. 蛋白質を選択し、太さ200のribbonで描画し、色をgroupで指定します。

select protein
ribbon 200
color group



4. NMRの構造はいくつかの構造を重ねて表示しているので、一つの構造のみ(ここでは1番の構造)を描画します。

restrict */1

完成!!
ぐるぐる回して遊んでみよう。